磁分离技术处理废水存在如下的技术难度和局限性：
介质的剩磁使得磁分离设备在系统反冲洗时，难以把被聚磁介质所吸附的磁性颗粒冲洗干净，因而影响着下一周期的工作效率。

精密分离系统突破了这个局限，在处理高浓度废水和面临冲击负荷时，出水效果几乎不受影响，保证处理水量和出水效果。

为了提高磁场梯度，必须选择高磁饱和度的聚磁介质，对聚磁介质的选择具有一定的技术困难，且增加运行的费用。

它不同于传统工艺依靠重力分离悬浮物，而采用稀土永磁技术，变被动沉淀为主动的吸附打捞，使分离的效率提高。超磁分离技术分离出的污泥含水率小于93%。工艺水力停留时间小于5分钟，使得占地面积极小。处理10000立方米每天水量的全套设备装机功率仅40余千瓦。

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